Masih mengusung jenis mesin yang sama yaitu 160cc.
Bentuk body dan mesin motor ini tidak berubah hingga tahun 2005.
3. Mega Pro Generasi Ketiga
Pada tahun 2006, Honda melakukan inovasi baru dengan merubah bentuk body motor ini.
Bentuk body yang berubah mulai dari desain lampu belakang, jok, sparkbor depan belakang, body samping, hingga tangki.
Wujud ini bertahan hingga tahun 2009.
Sebenarnya simpel saja kenapa Mega Pro generasi ketiga ini banyak orang menyebutnya Mega Pro Primus.
Sebab terdapat salah satu iklan pada seri motor ini yang bintang iklannya Primus Yustisio.
Kalau nggak percaya, nih tonton video iklannya.