Desa Babalan, Banjarsari, Gebang, Gempolsari, Karaban, Koripandriyo, Pantirejo, Penaggungan, Plumbungan, Soko, Sunggingwarno, Tanjang, Tlogoayu dan Wuwur.
3. Kecamatan Jaken
Desa Kebonturi, Mojoluhur, Sriwedari dan Sumberarum.
4. Kecamatan Jakenan
Desa Jakenan, Jatisari, Karangrejo Lor, Mantingan Tengah dan Sidomulyo
5. Kecamatan Kayen
Hanya ada satu desa yang diprediksi dilewati proyek tol, yakni Desa Talun.
6. Kecamatan Pati
Satu desa yang dilewati proyek tol yaitu Desa Gajahmati.
7. Kecamatan Pucakwangi
Desa Grogolsari, Karangrejo dan Plosorejo.
8. Kecamatan Sukolilo
Cuma satu desa yang dilewati, yakni Desa Wotan.
9. Kecamatan Winong
Desa Karangkonang, Kebowan, Klecoregonang, Mintorahayu, Sarimulyo, Tanggel, Tawangrejo dan Winong.
Artikel ini telah tayang di TribunJateng.com dengan judul Proyek Nasional Jalan Tol Demak-Tuban Akan Lewati 39 Desa di Pati.