Pada side panelnya diberi grafis bertuliskan 'X13' yang merupakan nama dari motor ini.
(Baca Juga: Yamaha RX-King Sudah Tobat, Gaya Flat Track Sekarang Jadi Kiblatnya)
Untuk mendapatkan desain cafe racer, setang clip-on dipasang dengan lampu sein bar-end agar kokpit terlihat resik.
Lalu footrest juga dibuat agak mundur sehingga posisi riding makin nunduk seperti cafe racer kebanyakan.
Untuk kaki-kaki, kedua peleknya menggunakan milik Bajaj Pulsar kemudian swingarm dibuat lebih panjang dan diberi shock belakang baru.
Terakhir, Yamaha X13 ini diberi knalpot baru dengan muffler berukuran cukup besar.